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表观生物学

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m6A测序

技术简介:

m6A(N6-methyladenosine,6-甲基腺苷)是真核生物中最常见最丰富的RNA修饰,作为一种可逆修饰,RNA既可以在甲基化转移酶METTL3/14 等酶的作用下发生m6A甲基化修饰,又可以在FTO、ALKBH5等酶的作用下发生去甲基化修饰;另外,它能够通过YTHDC1/2 等m6A 识别因子发挥重要功能,例如目前已发现 m6A 在调控基因表达、剪接、RNA编辑、RNA稳定性、控制mRNA寿命和降解、介导环状RNA翻译等方面扮演重要角色 。    
    目前对m6A的转录组研究的主要方法为MeRIP-seq(methylated RNA immunoprecipitation sequencing),其原理是通过m6A特异性抗体识别并结合具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀,对富集下来的RNA分子进行二代测序。结合生物信息学分析,即可在全转录组范围内对m6A修饰进行系统研究。

技术流程:

 样品要求:

样品类型:细胞、新鲜组织或RNA样品。
样品总量: 细胞样品 10*8 个细胞,组织 5 g 的组织块或切片,总RNA 样品 200 μg 以上

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