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分子互作

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ChIRP

                                                                       ChIRP

技术概述
ChIRP是研究体内RNA与蛋白互作的有力工具。该技术在特定时间点用甲醛交联等方式固定细胞内RNA与蛋白及核酸的互作复合物,再利用生物素标记的探针及链霉亲和素磁珠纯化出靶RNA及其与它结合的蛋白、核酸复合物,复合物中的蛋白质被洗脱下来做western-blot,可以验证某个蛋白是否与靶RNA结合;洗脱下来的蛋白液做质谱鉴定,即可筛选出与目的RNA结合的蛋白。
 
技术原理
生物素与链霉亲和素间的作用是目前已知强度最高的非共价作用;其中活化生物素可以在蛋白质交联剂的介导下,与已知的几乎所有生物大分子偶联。
 
ChIRP技术利用生物素标记探针识别靶RNA,在纯化靶RNA的同时将与它结合的蛋白也一并纯化出来,洗脱得到靶RNA的结合蛋白质。

技术应用
RNA结合蛋白在体内条件下的验证和筛选。

技术流程



服务信息


 

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