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分子互作

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DNA pull down

DNA pull down

技术概述
DNA pull down-MS是体外研究DNA与蛋白互作的有力工具。该技术将生物素标记的DNA片段结合在链霉亲和素磁珠上,再与细胞核蛋白孵育,纯化出与DNA片段互作的蛋白,洗涤洗脱得到的蛋白产物,做western-blot检测特定蛋白是否与靶DNA片段结合;做质谱鉴定即可筛选出与DNA片段可能互作的蛋白信息(如具体某个或某些转录因子/组蛋白等)。
 
技术原理
 
生物素与链霉亲和素间的作用是目前已知强度最高的非共价作用;其中活化生物素可以在蛋白质交联剂的介导下,与已知的几乎所有生物大分子偶联。因此用生物素标记核酸后,利用生物素和链霉亲和素之间的亲和作用,可以纯化出各种生物大分子复合物。
       
DNA pull down实验首先针对靶标区域设计DNA探针,探针经过脱硫生物素标记,跟偶联在磁珠上的链霉亲和素结合;细胞核提取物与磁珠-DNA探针孵育,纯化出与靶DNA片段结合的蛋白复合体,洗脱得到DNA片段的结合蛋白质。




服务内容

RNA pull down

 技术概述       
RNA pull down是体外研究RNA与蛋白互作的重要技术。该技术通过体外转录靶RNA的一部分或全长,用生物素标记转录产物,再与蛋白提取液孵育,形成RNA-蛋白质复合物。该复合物可与链霉亲和素磁珠结合,从而把靶RNA结合蛋白从蛋白提取液中分离出来。复合物从磁珠上洗脱下来,通过western blot实验检测特定的RNA结合蛋白是否与靶RNA结合;通过质谱仪检测,可以筛选到与靶RNA结合的蛋白。
 
技术原理  
生物素与链霉亲和素间的作用是目前已知强度最高的非共价作用;其中活化生物素可以在蛋白质交联剂的介导下,与已知的几乎所有生物大分子偶联。因此用生物素标记核酸后,利用生物素和链霉亲和素之间的亲和作用,可以纯化出各种生物大分子复合物。
       
RNA pull down实验是用生物素标记体外转录的靶RNA分子,再用链霉亲和素纯化出与靶RNA结合的蛋白复合体,洗脱得到RNA结合蛋白质。
 
技术应用
靶RNA结合蛋白的验证或筛选。



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