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蛋白质谱

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PRM

技术简介:

PRM(平行反应监视,parallel reaction monitoring)是目前靶向蛋白质组学的主流方法之一,
通过对特异性肽段或目标肽段(如发生翻译后修饰的肽段)进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质/修饰肽段的靶向相对或绝对定量。其检测原理是:首先利用四级杆高分辨率、高精度质谱仪质量分析器选择性的检测目标肽段的母离子信息,随后在HCD碰撞池中发碎裂,最后进入高分辨率、高质量精度的Orbitrap分析器中,检测所选择的母离子窗口内的所有碎片离子信息,即可对复杂样本中的目标蛋白/肽段进行特异性的定量分析。

仪器设备

•Thermo Scientific Q Exactive HF-X
•Thermo Scientific Orbitrap Fusion Lumos
•Thermo Scientific Q Exactive

技术优势

1/灵敏度高:质量精度达到ppm级,能够比SRM/MRM更好地排除背景干扰和假阳性;
2/方法学建立更简单:对子离子进行全扫描,无需选择离子对和优化碎裂能量,只需要在数据处理时选择响应最高的一个或几个子离子,即可提取母子离子对的色谱峰进行定量;
3/线性范围宽:可达5~6个数量级;
4/检测通量高:与传统的Western-blot方法比,不依赖于抗体,可以一次性检测数十种蛋白。

应用范围

验证高通量定量蛋白质组学(如iTRAQ、TMT、SILACLabel free)的实验结果;
对目标蛋白质相对或绝对定量分析
 

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